Фудзи первоначально разрабатывалась как 4-х километровая, высокоскоростная трасса, но из-за нехватки денег была недостроена. Преобразованная в дорожную, трасса открылась в декабре 1965 г. и оказалась несколько опасной. Здесь регулярно происходили несчастные случаи. Трассу решили перестроить. Обновленный вариант трассы составлял 4.359 км и оказался более удачным.

Фудзи приняла первую гонку Формулы-1 в конце 1976 года. Тогда дождевую гонку выиграл М. Андретти. А в 1977 году по ходу гонки произошла ужасная авария. Ferrari Жиля Вильнёва налетела сзади на Tyrrell Ронни Петерсона, перелетела через ограждения и убила маршала и фотографа. Это была вторая и последняя гонка, когда Фудзи принимала у себя Формулу-1. А, начиная с 1987 года, Гран-при Японии проводился на Сузуке. Фудзи же, оставаясь популярной трассой, использовалась для проведения национальных чемпионатов.

В 2003 году Герман Тильке серьезно переделал автодром, а в частности повороты и прямые. Также был уложен новый асфальт и увеличены зоны безопасности. Фудзи является трассой с самой длинной прямой в Формуле-1 – почти 1,5 км. А трибуны смогут единовременно принимать до 140 тысяч человек.

В 2007 году после долгого перерыва Формула-1 вернется в Фудзи.